В ходе чина интронизации митрополиты Киевский и Санкт-Петербургский возвели нареченного Патриарха на Патриаршее горнее место (трон). Два экзарха трижды посадили нареченного Первосвятителя на трон в алтаре храма Христа Спасителя и трижды подняли с него. каждый раз это сопровождалось возгласом "Аксиос!", что в переводе с греческого означает "Достоин!". В этот момент, нареченный Патриарх Кирилл официально стал главой РПЦ. После чего его переоблачили и прочли молитву за поставленного Патриарха. Колокола всех четырех колоколен храма оповестили, что Церковь обрела нового предстоятеля. Для этого был специально восстановлен исторический колокольный звон, который был разработан во времена Бориса Годунова.

На интронизации присутствовал президент России Дмитрий Медведев.