Согласно закону «О Центральном банке», председатель ЦБ назначается на должность Госдумой на четыре года простым большинством голосов. Пост председателя ЦБ нельзя занимать более трех сроков подряд.

Вступив в должность председателя ЦБ в марте 2002 года, Игнатьев сменил двух ключевых первых замов — денежно-кредитную политику стал курировать Олег Вьюгин, работавший вместе с Игнатьевым в Минфине, а банковский надзор — Андрей Козлов. Весной 2004 года Вьюгина, возглавившего Федеральную службу по финансовым рынкам, сменил Алексей Улюкаев, также выходец из Минфина.

В сентябре 2006 года Козлов был убит в результате покушения. Через несколько месяцев банковский надзор в должности первого зампреда ЦБ стал курировать Геннадий Меликьян, до этого возглавлявший Главную инспекцию кредитных организаций ЦБ.